One of my collaborators is installing gt from source on CentOS. He runs gt sketch, but the resulting .png file is blank. Has anyone else seen this issue?<div><br></div><div>Thanks,</div><div>Marty<br><br><div class="gmail_quote">
<br><div style="word-wrap:break-word"><div>_________________________________________________--</div><div>Apart from some library and include-file path issues, everything seems to compile fine (various &quot;yum install ...&quot; -&gt; pixman -&gt; cairo -&gt; gt). However, running a test command like:</div>
<div><br></div><div><span style="white-space:pre">        /tmp/gt/genometools-1.3.3/bin/gt sketch -width 1065 -style /tmp/gt/genometools-1.3.3/gtdata/sketch/default.style -force -flattenfiles -addintrons -seqid 1 -start 1000000 -end 2000000 test.png seq1.gff3</span></div>
<div><br></div><div>results in a nearly blank png image.</div><div>____________________________________________________________________________</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div></div>
Martin Gollery<br>Senior Bioinformatics Scientist<br>Tahoe Informatics<br><a href="http://www.bioinformaticist.biz">www.bioinformaticist.biz</a><br><a href="http://www.hiddenmarkovmodels.com">www.hiddenmarkovmodels.com</a><br>
<br><br>
</div>